單細(xì)胞測(cè)序揭示潰瘍性結(jié)腸炎中干細(xì)胞的衰老狀態(tài)
摘要: 目的 分析潰瘍性結(jié)腸炎發(fā)生發(fā)展過程中細(xì)胞類型以及基因表達(dá)的動(dòng)態(tài)變化。方法 采用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)對(duì)潰瘍性結(jié)腸炎模型鼠以及正常鼠的腸道組織進(jìn)行生物信息學(xué)分析。經(jīng)過質(zhì)控,共有58 714個(gè)細(xì)胞用于構(gòu)建結(jié)腸炎數(shù)據(jù)集進(jìn)行下游分析,再通過降維聚類、基因本體(gene ontology, GO)分析和Monocle擬時(shí)間分析等技術(shù)手段著重分析了結(jié)腸炎發(fā)生發(fā)展過程中的上皮區(qū)室變化。結(jié)果 在結(jié)腸炎... ...
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