四川省首例猴痘病例病毒基因組特征分析
摘要: 目的 分析四川省首例猴痘病例感染病毒全基因組特征,為猴痘防控工作提供基礎(chǔ)資料。方法 采集病例咽拭子和皰疹液拭子提取核酸,用實(shí)時(shí)熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)進(jìn)行初篩,確認(rèn)陽性后用納米孔測(cè)序進(jìn)行全基因組測(cè)序。測(cè)序數(shù)據(jù)用Minimap2 v2.18-r1015、Medaka v1.8.0、Snpeff v4.3.1軟件進(jìn)行組裝、核苷酸突變位點(diǎn)識(shí)別和功能注釋,通過在線分析平臺(tái)Nextc... ...
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